Сергей Маховиков родился 22 октября 1963 года в Ленинграде. Детство провёл в Павловске. После окончания школы поступил на штурманский факультет в ВВМУ им М. В. Фрунзе, перевёлся в Военно-механический институт на отделение «Ракеты», но уже после первого курса отчислился из института. В 1983 году поступил в ЛГИТМИК на актёрский факультет (курс народного артиста СССР Игоря Горбачёва). Начиная со второго курса, был занят в спектаклях Александринского театра. Параллельно обучался режиссуре у М. В. Сулимова.

Подробная информация по ссылке:
https://ru.wikipedia.org/wiki/%D0%9C%D0%B0%D1%85%D0%BE%D0%B2%D0%B8%D0%BA%D0%BE%D0%B2,_%D0%A1%D0%B5%D1%80%D0%B3%D0%B5%D0%B9_%D0%90%D0%BD%D0%B0%D1%82%D0%BE%D0%BB%D1%8C%D0%B5%D0%B2%D0%B8%D1%87